Table des matières
- Type de publication : Chapitre d’ouvrage
- Ouvrage : Cladistique et Évolution. Une fondation problématique
- Pages : 443 à 448
- Collection : Histoire et philosophie des sciences, n° 18
- Thème CLIL : 3126 -- SCIENCES HUMAINES ET SOCIALES, LETTRES -- Philosophie
- EAN : 9782406063391
- ISBN : 978-2-406-06339-1
- ISSN : 2260-9873
- DOI : 10.15122/isbn.978-2-406-06339-1.p.0443
- Éditeur : Classiques Garnier
- Mise en ligne : 19/07/2018
- Langue : Français
TABLE DES MATIÈRES
AVERTISSEMENT 9
PRÉFACE 11
INTRODUCTION 17
PREMIÈRE PARTIE
ESPÈCES
LE PROBLÈME DE L’ESPÈCE CHEZ WILLI HENNIG 49
L’espèce comme unité d’évolution 50
La taxinomie spécifique comme laboratoire
d’expérimentation méthodique 53
La redéfinition du concept biologique de l’espèce 55
La dimension holomorphologique 57
La dimension spatiale 60
La dimension temporelle 66
La redéfinition du concept biologique de l’espèce : bilan 71
Conclusion 75
LA RECHERCHE D’UN CONCEPT CLADISTIQUE DE L’ESPÈCE 77
Le concept synapomorphique de Mishler et Donoghue 78
La critique de Mishler et Donoghue 78
Le concept synapomorphique de l’espèce 82
Les difficultés du concept synapomorphique de l’espèce 86
Le concept synapomorphique de l’espèce : bilan 88
444Le concept autapomorphique de Nelson et Platnick 89
La critique de Platnick 90
Le concept autapomorphique de l’espèce 94
Le concept autapomorphique de l’espèce : bilan 103
Conclusion 103
DEUXIÈME PARTIE
HOMOLOGIES PRIMAIRES
LA DÉFINITION ET LE CHOIX DES TRAITS 107
Définitions préliminaires 108
Traits, parties et attributs 109
Caractères, états de caractère et homologie 110
La définition des traits 115
Les traits sont observables 116
Les traits font l’objet d’un consensus entre chercheurs 117
Les traits forment des séries de transformations réelles 118
Les traits sont le produit de processus de transformation
onto- et phylogénétiques 121
La définition des traits : bilan 122
Le choix des traits 124
L’exemple évolutionniste 125
La critique des critères néodarwiniens 127
La réduction des critères de choix
à des critères purement pratiques 129
Le choix des traits : bilan 132
Conclusion 133
LES DÉFINITIONS DE L’HOMOLOGIE 135
Une brève histoire du concept d’homologie 136
Les homologues comme modifications
de l’archétype selon Owen 138
Les homologues comme modifications
de l’ancêtre selon Darwin 142
Homogénie et homoplasie selon Lankester 148
Owen, Darwin, Lankester : bilan 152
Les définitions cladistiques de l’homologie 154
La définition transformationnelle 155
La définition taxique 167
Conclusion 182
LES CRITÈRES DE L’HOMOLOGIE 183
L’identification des homologues 186
Le critère de la ressemblance 186
Les critères de Remane 194
L’orientation des homologues 207
Le critère de la comparaison extragroupe 208
Le critère ontogénétique 216
Les critères auxiliaires 236
Conclusion 246
TROISIÈME PARTIE
CLADOGRAMME
Qu’est-ce qu’un cladogramme ? 251
La structure hiérarchique du cladogramme 252
La fondation empirique de Hennig 252
Les difficultés de la fondation empirique 256
La refondation méthodico-empirique de Brady 262
La structure hiérarchique du cladogramme : bilan 267
Le caractère dichotomique du cladogramme 269
La fondation méthodico-empirique de Hennig 269
La refondation méthodique de Platnick 272
Le caractère dichotomique du cladogramme : bilan 275
446Les éléments du cladogramme :
feuilles, branches et points de branchement 276
Le schéma d’argumentation de Hennig 277
Cladogrammes et arbres phylogénétiques
selon Nelson et Platnick 282
Les éléments du cladogramme : bilan 293
Conclusion 295
CONSTRUIRE UN CLADOGRAMME 297
Les trois types d’axiomatisation 298
Les pétitions de principe 298
Les axiomatisations poppériennes 299
L’axiomatisation de Farris et al. 300
Les axiomatisations poppériennes de Wiley et Gaffney 302
Objectifs 302
Définition et fonction des axiomes 305
Les hypothèses cladistiques et leur test 306
Apparition, définition et fonction
du principe de parcimonie 311
La cladistique est-elle compréhensible
en termes poppériens ? 313
La cladistique est-elle une théorie ? 313
Les hypothèses cladistiques peuvent-elles
être soumises à un test au sens de Popper ? 318
Les hypothèses cladistiques se déduisent-elles
les unes des autres ? 320
Objections et réponses à notre critique 322
Les taxons sont-ils des types ? 322
Est-il possible d’en dériver des énoncés falsifiables ? 326
Le problème de la parcimonie 328
Conclusion 330
Le principe de parcimonie 333
Le principe auxiliaire de Hennig 335
Présentation du principe auxiliaire
et choix terminologiques 336
Première et deuxième étapes : principe général
de la méthode et description d’un cas problématique 339
Troisième étape : le nombre comme critère de choix 341
Quatrième étape : le principe auxiliaire 343
Le principe auxiliaire de Hennig : bilan 346
La parcimonie de Wagner 346
Argumentation hennigienne
versus parcimonie de Wagner 346
Le problème de l’optimisation des caractères 354
La justification de la parcimonie de Wagner 356
Parcimonie et vraisemblance selon Sober 369
La critique de l’argument négatif de Farris 370
Présentation et discussion
de l’argument positif de Sober 373
Conclusion 385
QUATRIÈME PARTIE
CLASSIFICATION
DU CLADOGRAMME À LA CLASSIFICATION 389
L’exemple de la systématique évolutionniste 390
Les racines darwiniennes 390
L’apport des néodarwiniens 392
Mayr versus Hennig : grades et clades 396
La critique de Mayr 396
La réponse de Hennig 400
Solutions cladistiques 405
La formation des groupes 405
L’assignation de rangs 409
Conclusion 415
CONCLUSION 417
448BIBLIOGRAPHIE 425
INDEX DES NOMS DE PERSONNES 437
TABLE DES FIGURES 441